在选择POS机手续费最低的银行机构时，首先需要考虑的是不同银行机构之间的费率差异。不同银行机构对于POS机的手续费收取方式和费率标准可能存在差异。有些银行可能采用固定费用的方式，而有些银行可能采用按交易额的百分比进行收费。在选择银行机构时，需要仔细比较各家银行的手续费率，选择手续费最低的银行。
2. 交易类型的考虑
不同的POS机交易类型可能会对手续费产生影响。银行对于不同类型的交易可能会有不同的费率标准。对于信用交易和储蓄卡交易，银行可能会采用不同的手续费率。在选择POS机时，需要根据自己的业务类型和交易类型来选择手续费最低的POS机。
交易金额也会对POS机手续费产生影响。银行会根据交易金额的大小来决定手续费的收取方式和费率。一般问题下，交易金额越大，手续费率可能会相对较低。在选择POS机时，需要根据自己的交易金额来选择手续费最低的POS机。
4. 额外费用的考虑
除了基本的手续费外，还需要考虑是否存在其他额外费用。有些银行可能会收取一些额外费用，例如年费、维护费或者交易手续费外的其他费用。在选择POS机时，需要综合考虑所有可能的费用，选择手续费最低且不带有额外费用的POS机。
商户自身的需求同样是选择手续费最低的POS机的重要因素。商户需要根据自己的业务模式、交易量和交易频率来选择适合自己的POS机。有些银行可能会提供一些定制化的服务和费率，以满足商户的特殊需求。在选择POS机时，商户需要充分考虑自身的需求，并选择最符合自己需求的POS机。
选择手续费最低的POS机需要考虑银行机构的选择、交易类型、交易金额、额外费用和商户需求等多个方面。商户应该综合考虑这些因素，并选择最符合自身需求的POS机。